chemTag - Extraction d’entités nommées en chimie

Niveau d'utilisation :  Débutant
Niveau de validation :  Validé
Objectif

Ce web service détecte, dans un texte en anglais, les entités nommées en chimie.

Méthode

Les entités nommées sont toutes renvoyées dans un champ “chemical”.

Le modèle utilisé par ce web service, “bio-ner”, est disponible à ce lien huggingface.
Aucun fine-tuning n’a été opéré : nous mettons simplement le modèle à disposition via un web service.

Le code git pour fine-tuner le modèle est disponible à ce lien.

Métriques

Le modèle possède une f-mesure de 0.92 ± 0.02.

Précaution : Le web service fonctionne uniquement sur du texte anglais.

Références
Traitement

Single atoms of elements are not molecules. A single oxygen, O, is not a molecule. When oxygen bonds to itself (e.g., O3) or to another element (e.g., carbon dioxide or CO2), molecules are formed==>chemical: oxygen, O, O3, carbon dioxide, CO2

This is three chemical named entities: methanol, 2-propanol, or CO2. ==> chemical: methanol, 2-propanol, CO2

Vous avez un corpus et vous souhaitez en connaître le contenu ?

En lançant chemTag sur vos données depuis Lodex, logiciel libre de visualisation, vous obtiendrez la liste de termes chimiques et des représentations graphiques liées.

Graphe réalisé à partir des données du corpus Istex “Biodiversité”. Sont affichées les valeurs supérieures à 10.

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